Карта сайта


Русскоязычная часть:

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр Южный научный центр Российской академии наук»

Лаборатория экспериментальной биологии


Телефон: (863) 250-98-15 (внут.тел. 403)
Адрес: 344006, Ростов-на-Дону, ул.Чехова, 41
Эл. почта: eachernogubova@mail.ru

Черногубова Елена Александровна

ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук, заведующая лабораторией
(863) 250-98-15 (внут.тел. 403)
echernogubova@rambler.ru

Вербицкий Евгений Васильевич

доктор биологических наук, профессор
(863)2509813
eugeny@ssc-ras.ru

Коган Михаил Иосифович

главный научный сотрудник, доктор медицинских наук, профессор
dept_kogan@mail.ru

Кондаков Андрей Анатольевич

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник
a_kondakov@ssc-ras.ru

Машкарина Айна Николаевна

старший лаборант с высшим образованием
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 403)
aina_mashkarina@mail.ru

Махоткин Михаил Александрович

научный сотрудник
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 404)
makhotkin@ssc-ras.ru

Набока Анастасия Викторовна

старший лаборант с высшим образованием
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 403)
korsunova.anastasia@yandex.ru

Тютякина Мария Геннадьевна

младший научный сотрудник
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 403)
tyutyakina@mail.ru

Федоренко Григорий Мефодьевич

главный научный сотрудник, доктор биологических наук
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 403), (863) 243-36-44
gfedorenko@mail.ru

Черкасова Елена Николаевна

старший лаборант с высшим образованием
(863) 250-98-15 (внутр.тел. 403)
cherkasova@ssc-ras.ru


 Laboratory of Molecular Biology (read in English...)

Адрес лаборатории: 344006, Ростов-на-Дону, ул.Чехова, 41, Южный научный центр РАН

Телефон: (863) 250-98-15 (внут.тел. 403)
Address: 344006, 41 Chekhov st, Rostov-on-Don, Russia
Telephone: (863) 250-98-15

Подразделение создано в 2005 году.


 Оборудование и методы научных исследований 


Цели, задачи, направления исследований

  • Идентификация и анализ генетических и эпигенетических детерминант, участвующих в контроле развития злокачественных опухолей и ответе клеток на стрессовые воздействия
  • Изучение механизмов адаптации млекопитающих и человека к факторам среды в цикле сон-бодрствование.
  • Сохранение природно-ресурсного потенциала экологически уязвимых районов юга России в условиях климатических и техногенных вызовов.

Основные выполняемые проекты

  1. Идентификация и анализ генетических и эпигенетических детерминант, участвующих в контроле развития злокачественных опухолей и ответе клеток на стрессовые воздействия (№ гос.рег. 01201363192)
Руководитель – д.м.н. М.И. Коган
Отв. исп. – к.б.н. М.М. Махоткин
  1. Изучение механизмов адаптации млекопитающих и человека к факторам среды в цикле сон-бодрствование (№ гос.рег. 01201363190)   
Руководитель – д.б.н. Е.В.Вербицкий
  1. Сохранение природно-ресурсного потенциала экологически уязвимых районов юга России в условиях климатических и техногенных вызовов (№ гос.рег. AAAA-A18-118011990300-9)
Руководитель – к.б.н.В.В. Стахеев
  1. Программа Президиума РАН «Проблемы развития полиэтничного макрорегиона в условиях дестабилизации Каспийско-черноморского зарубежья» проект "География и динамика онкологических заболеваний в регионах Южного федерального округа" (№ гос.рег. АААА-А16-116011910024-0
подпроект "Изучение связи между неблагоприятными факторами внешней среды и эпигенетическими нарушениями генома и возможность использования эпигенетических маркеров для оценки влияния экологической нагрузки на состояние здоровья человека" Руководитель – д.б.н. В.А. Тарасов
Отв. исполнитель – Бойко Н.В.
подпроект "Интеллектуальная информационная система мониторинга медико-экологической безопасности территорий ЮФО".
Руководитель – д.б.н. В.А. Тарасов
Отв. исполнитель – к.т.н. Архипова О.Е., к.б.н. Черногубова Е.А.
  1. ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям
развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы»
«Идентификация и разработка маркеров для прогнозирования клинически агрессивных форм рака предстательной железы» (Соглашение о предоставлении субсидии от «27» ноября 2014 г. № 14.607.21.0099,Уникальный идентификатор прикладных научных исследований RFMEFI60714X0099
Руководитель – д.г.н., чл.-корр. РАН Д.Г. Митишов (2014-2015), к.б.н. Черногубова Е.А . (2015-2018)
Отв. исполнитель – д.м.н., профессор Коган М.И.
  1. Грант РФФИ № 13-04-01408 "Анализ роли микроРНК-зависимого транскрипционного замолкания генов в индуцированной структурной нестабильности генома"
Руководитель – д.б.н. В.А. Тарасов

Основные публикации, РИД (2015-2019)

КОЛЛЕКТИВНЫЕ МОНОГРАФИИ

1.Пространственно-временной анализ встречаемости онкологических заболеваний как индикатора медико-экологической безопасности /О.Е.Архипова, Е.А. Черногубова, Н.В.Лихтанская [и др.]; под ред. чл. корр. РАН Д.Г. Матишова. – Ростов н/Д: Изд-во Южного научного центра РАН, 2014. – 224 с. –ISBN 978-5-4358-0079-1.
2. Рак простаты: от протеомики и геномики к хирургии /под ред. проф. М.И. Когана и проф. Д.Ю. Пушкаря/ Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2017. – 288 с. ISBN 978-5-4358-0138-5.
3. Рак предстательной железы: протеомика, геномика, хирургия /науч. ред. проф. М.И. Коган и проф. Д.Ю. Пушкарь/ - М.: ИД ««АБВ-пресс» , 2019. – 384 с. ISBN 978-5-903018-64-2.
4. Инфекции и воспаления в урологии / под ред. П.В. Глыбочко, М.И. Когана, Ю.Л. Набока. — 2019. — 888 с.



ОБЪЕКТЫ ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ (АВТОРСКИЕ СВИДЕТЕЛЬСТВА И ПАТЕНТЫ, ЗАРЕГИСТРИРОВАННЫЕ ПРОГРАММЫ, ПАТЕНТЫ)


1.     Коган М.И., Чибичян М.Б, Черногубова Е.А., Матишов Д.Г., Павленко И.А., Мационис А. Э., Повилайтите П.Э. Способ прогнозирования риска развития биохимического рецидив у больных раком предстательной железы после гормонолучевой терапии// патент РФ на изобретение № 2605838 от 06.12.2016 Бюл БИМП №36 27.12.2016

2.     Коган М.И., Чибичян М.Б., Лаптева Т.О., Белоусов И.И., Иванов А.Г. Черногубова Е.А. Способ прогнозирования риска развития стеноза везикоуретрального анастомоза после радикальной простатэктомии// патент РФ на изобретение № 2631606 от 18.07.2016 Бюл БИМП №27 25.09.2017



СТАТЬИ В ЖУРНАЛАХ, ИНДЕКСИРУЕМЫХ В  WEB OF
 SCIENCE, SCOPUS:

 

1.Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Мационис А.Э., Повилайтите П.Э., Матишов Д.Г. Роль калликреин-кининовой и ренин-ангиотензиновой систем в патогенезе рака предстательной железы.// Урология. – 2015.- №3 – С. 50-54.

2.Чибичян М.Б., Коган М.И.,  Лаптева Т.О., Белоусов И.И., Иванов, А.Г.  Черногубова Е.А. Перипростатическое воспаление как фактор риска развития стеноза везико-уретрального анастомоза после радикальной простатэктомии.// Урология. – 2015.- № 6 – С. 52-57.
3. Uzdensky Anatoly, Fedorenko Grigory, Neginskaya Marya, Fedorenko Alexej. "The paired neuroglial and interglial membranes in the crayfish stretch receptor and their local disorganization".  Journal  of NeuroscienceResearch – 2015 - 93:707 - 713
4. Монахова Е.В., Федоренко Г.М., Мазрухо А.Б., Бардахчьян Э.А. Ультраструктурные изменения в кишечнике кроликов-сосунков, зараженных холерогенным и нехолерогенным штаммами холерных вибрионов неО1/неО139 серогрупп // Бюл. эксперим. биол и медицины. 2015. № 5.  С. 637-642.
Monakhova E.V., Fedorenko G.M., Mazrukho A.B., Bardakhch’yan E.A. Ultrastructural Changes in the Intestine of Suckling Rabbits Infected with Cholerogenic and Non-Cholerogenic nonO1/nonO139 Vibrio cholerae Strains // Bulletin of Experimental Biology and Medicine, Vol. 159, No. 5, September, 2015. P. 675–679. DOI 10.1007/s10517-015-3045-z
5. Сысоева Ю.Ю., Вербицкий Е.В. Характер активаций мозга во время ночного сна связан с личностной тревожностью индивидуума //Доклады Академии наук. 2015. Т. 461. № 2. С. 236.
Sysoeva Y.Y., Verbitsky E.V. Characteristics of sleep-related arousals depend on trait anxiety// Doklady Biological Sciences. 2015. Т. 461. № 1. С. 73-75.
6. Тарасов В.А., Махоткин М.А., Шин Е.Ф., Бойко Н.В., Тютякина М.Г., Чикунов И.Е., Набока А.В., Машкарина А.Н., Кирпий А.А., Матишов Д.Г. Изменение селекции нитей микроРНК при индукции повреждений ДНК // Доклады академии наук. 2016. Т. 467. № 2. С. 226–228.
Tarasov V.A., Makhotkin M.A., Shin E.F., Boiko N.V., Tyutyakina M.G., Chikunov I.E., Naboka A.V., Mashkarina A.N., Matishov D.G., Kirpii A.A. CHANGE IN THE SELECTION OF MICRORNA STRANDS DURING DNA DAMAGE INDUCTION Doklady Biochemistry and Biophysics. 2016. Т. 467. № 1. С. 99-101. 
7.Тарасов В.А., Бойко Н.В., Махоткин М.А., Шин Е.Ф., Тютякина М.Г., Чикунов И.Е., Набока А.В., Машкарина А.Н., Кирпий А.А., Матишов Д.Г. Зависимость индуцированной митомицином С аберрантной экспрессии микроРНК от метилирования ДНК // Генетика. 2016. Т. 52. № 11. С. 1233–1240.
Tarasov V.A., Boyko N.V., Makhotkin M.A., Shin E.F., Tyutyakina M.G., Chikunov I.E., Naboka A.V., Mashkarina A.N., Matishov D.G., Kirpiy A.A.THE MIRNA ABERRANT EXPRESSION DEPENDENCE ON DNA METHYLATION IN HELA CELLS TREATED WITH MITOMYCIN//Russian Journal of Genetics. 2016. Т. 52. № 11. С. 1117-1123. 
8.Чибичян М.Б., Коган М.И., Черногубова Е.А., Павленко И.А. Матишов Д.Г. Роль рецепторов ангиотензина  II   второго типа в прогнозировании биохимического рецидива при терапии рака предстательной железы// Урология.2016, 6: С.89-94. 

9.Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Матишов Д.Г.  Ангиотензинпревращающий фермент – новый прогностический маркер рецидива при терапии рака предстательной железы// Онкоурология. 2016, 4: С.87-93.

10.Архипова О.Е., Е.А. Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Коган М.И. Эпидемиология рака предстательной железы в Ростовской области. Пространственно-временная статистика//Онкоурология, 2016, №4, 52-59.

11.Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б. Прогностические маркеры рецидива рака предстательной железы после радикальной простатэктомии// Медицинский вестник Северного Кавказа. 2016, Т.11, №4: С.511-515.

12.Arkhipova O.E., Chernogubova E.A.  Indicator of the medical-ecological safety (HES) of the Southern regions of Russia В сборнике: International Multidisciplinary Scientific GeoConference Surveying Geology and Mining Ecology Management, SGEM 16, Ecology, Economics, Education and Legislation. Сер. "16th International Multidisciplinary Scientific GeoConference, SGEM 2016: Nano, Bio and Green - Technologies for a Sustainable Future, Conference Proceedings" 2016. С. 471-476.

Doi: 10.5593/SGEM2016/B52/S20.060  // 16th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2016,www.sgem.org, SGEM2016  Conference Proceedings, ISBN 978-619-7105-66-7 / ISSN 1314-2704, June 28 - July 6, 2016, Book5 Vol. 2, 471-476 pp  (Scopus).
13. Федоренко Г.М., Федоренко А.Г. 2016.Ультраструктурная организация сенсорных нейронов в абдоминальном мышечном рецепторном органе ракообразных ASTACUS LEPTODACTYLUS. Цитология. – 2016- 58(8): 567-574.
14. Vladimir Lysenko,  Grigory Fedorenko, Alexey Fedorenko, Evgeniya Kirichenko, Alexander Logvinov1, Tatyana Varduny1. Targeting of organelles into vacuoles and ultrastructure of flower petal epidermis of Petunia hybrida. 2016. Braz. J. Bot.39(1): 327-336.
15.Тарасов В.А., Махоткин М.А., Бойко Н.В., Шин Е.Ф., Тютякина М.Г., Чикунов И.Е., Набока А.В., Машкарина А.Н., Кирпий А.А., Матишов Д.Г. Роль метилирования ДНК в наследуемости индуцированной радиацией аберрантной экспрессии микроРНК // Генетика. 2017. Т. 53. № 5. С. 551–561.
Tarasov V.A., Makhotkin M.A., Boyko N.V., Shin E.F., Tyutyakina M.G., Chikunov I.E., Naboka A.V., Mashkarina A.N., Matishov D.G., Kirpiy A.A. IMPORTANCE OF DNA METHYLATION IN THE INHERITANCE OF RADIATION-INDUCED ABERRANT EXPRESSION OF MICRORNA  Russian Journal of Genetics. 2017. Т. 53. № 5. С. 551-560.
16. Uzdensky A, Demyanenko S, Fedorenko G, Lapteva T, Fedorenko A. Protein Profile and Morphological Alterations in Penumbra after Focal Photothrombotic Infarction in the Rat Cerebral Cortex. Mol Neurobiol. 2017, Volume 54, Issue 6, pp 4172–4188.
17. Вербицкий Е.В. Взаимоотношения тревоги и сна в эксперименте и клинике//Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 2017. Т. 117. № 4-2. С. 12-18
18. Литвиненко С.Н., Войнов В.Б., Вербицкий Е.В., Шерхов З.Х.Особенности кислородообеспечения мышечной деятельности лиц среднего возраста в условиях высокогорного восхождения//Теория и практика физической культуры. 2017. № 7. С. 38-40.
Litvinenko S.N., Voinov V.B., Verbitsky E.V., Sherkhov Z.Kh. OXYGEN SUPPLY FOR EFFICIENT MUSCULAR ACTIVITY OF MIDDLE-AGED AMATEUR MOUNTAINEERS//Theory and Practice of Physical Culture. 2017. № 7. С. 13 19. 

19. Тарасов В.А., Тютякина М.Г., Махоткин М.А., Шин Е.Ф., Набока А.В., Машкарина А.Н., Чеботарев Д.А., Черкасова Е.Н., Коган М.И., Чибичян М.Б., Матишов Д.Г. МикроРНК-зависимая регуляция экспрессии гена IGF1R в гормончувствительных и гормонрезистентных клетках рака простаты Доклады Академии наук. 2018. Т. 479. № 4. С. 464-467.

Tarasov V.A., Tyutyakina M.G., Makhotkin M.A., Shin E.F., Naboka A.V., Mashkarina A.N., Chebotarev D.A., Cherkasova E.N., Kogan M.I., Chibichyan M.B.,Matishov D.G. MicroRNA-DEPENDENT REGULATION OF IGF1R GENE EXPRESSION IN HORMONE-SENSITIVE AND HORMONE-RESISTANT PROSTATE CANCER  CELLS // Doklady biochemistry and biophysics. 2018. Т. 479. № 1. С. 101-104. 

20. Grigoriy M. Fedorenko, Aleksei G. Fedorenko, Tatiana M. Minkina, Saglara S. Mandzhieva, Svetlana N. Sushkova. 2018. Method for hydrophytic plant sample preparation for light and electron microscopy (studies on Phragmites australis Cav.) Journal: MethodsХ, 1213-1220.

21. Тарасов В.А., Набока А.В., Махоткин М.А., Чикунов И.Е., Тютякина М.Г., Чеботарев Д.А., Черкасова Е.Н., Коган М.И., Чибичян М.Б., Матишов Д.Г. Участие микроРНК в регуляции гормональной зависимости клеток рака простаты Генетика. 2019. Т. 55. № 6. С. 675-683.

22. Корниенко И.В., Чеботарев Д.А., Махоткин М.А., Григорьев В.А., Пономарева Е.Н., Матишов Г.Г. ТЕРМИНАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ И МЕХАНИЗМЫ ГЕТЕРОПЛАЗМИИ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ДНК У ОСЕТРОВЫХ РЫБ//Молекулярная биология. 2019. Т. 53. № 1. С. 53-63.


СТАТЬИ В ВЕСТНИКЕ ЮНЦ РАН:

  1. Набока А.В., Махоткин М.А., Тютякина М.Г., Чикунов И.Е., Тарасов В.А., Матишов Д.Г. Транскрипционная и посттранскрипционная регуляция в аберрантной экспрессии микрорнк при обработке клеток HELA митомицином С// Наука юга России. 2016. В. 4. С. 57-64.

  2. Чикунов И.Е., Набока А.В. Роль метилирования ДНК в регуляции дифференциальной экспрессии микроРНК в канцерогенезе // Наука юга России. 2016. В. 4. С. 50-56.

  3. Чеботарев Д.А., Махоткин М.А., Набока А.В., Тютякина М.Г., Тарасов В.А.Получение радиорезистентных вариантов клеток линий HELA И DU145//Наука Юга России. 2017. Т. 13. № 4. С. 101-106.

 
ПУБЛИКАЦИИ В ЖУРНАЛАХ ИЗ ПЕРЕЧНЯ ВАК

  1. Донцов Д.В., Шин Е.Ф., Амбалов Ю.М., Морданов С.В. Изменения белкового спектра плазмы крови, развивающиеся у больных хроническим гепатитом С под действием аутогемотерапии // Медицинский вестник Юга России. 2015. № 4. С. 39-44
  2. Коган М.И., Чибичян М.Б., Черногубова Е.А. Молекулярные механизмы развития биохимического рецидива после простатэктомиии при раке предстательной железы//Урологические ведомости. 2015. Т. 5. № 1. С. 18-19.
  3. Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б. Ренин-ангиотензиновая система в прогнозировании рецидива при терапии рака предстательной железы //Успехи молекулярной онкологии. 2016. – Т.3, №4. С. 118
  4. Чеботарев Д.А., Тютякина М.Г. Влияние чувствительности к андрогену на профили экспрессии микроРНК в клетках рака предстательной железы // Успехи молекулярной онкологии. 2016. – Т.3, №4. С. 52
  5. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б. Лейкоцитарная эластаза – маркер развития рецидива после радикальной простатэктомии // Успехи молекулярной онкологии. 2017. Т. 4 № 4: Приложение. С. 126.
  6. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Пространственно-временной анализ распространения рака предстательной железы (РПЖ) в районах Ростовской области // Успехи молекулярной онкологии. 2017. Т. 4 № 4: Приложение. С. 14.
  7. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б., Павленко И.А Активация локальной ренин-ангиотензиновой системы при раке предстательной железы//Успехи молекулярной онкологии. 2018. Т. 5. № 4.S5. С. 136-137.
  8. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б.Прогностические маркеры рецидива рака предстательной железы //Успехи молекулярной онкологии. 2018. Т. 5. № 4.S5. С. 137-138.
  9. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Пространственно-временные кластеры заболеваемости злокачественными новообразованиями в Ростовской области //Успехи молекулярной онкологии. 2018. Т. 5. № 4. S5. С. 20-21
  10. Черногубова Е.А, Коган М.И, Чибичян М.Б. Прогностические маркеры биохимического рецидива рака предстательной железы// Злокачественные опухоли. 2018. том  8 № 3 s 1 С. 252-253.
  11. Чибичян М.Б., Черногубова Е.А., Павленко И.А., Аветян А.В. Роль локальной ренин-ангиотензиновой системы в патогенезе рака предстательной железы//Урологические ведомости. 2018. Т.8 (спец выпуск). С.112-113.
  12. Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Аветян А.В. Роль ренин-ангиотензиновой системы предстательной железы в патогенезе её доброкачественной гиперплазии//Вестник Башкирского государственного медицинского университета. №5, 2019 . С.293-294
  13. Рябикина Е.В., Черногубова Е.А, Шатохин Ю.В., Снежко И.В., Герасимова О.В., Кудинова Э.Е. Новые критерии качества свежезамороженной плазмы // Медицинский вестник Юга России.- 2019.- Т.10,№1.- С. 65-71.
 
ПРОЧИЕ ПУБЛИКАЦИИ
  1. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Анализ пространственных закономерностей эпидемиологии рака простаты в ростовской области// Экология. Экономика. Информатика. Сборник статей: в 2-х т. Т. 1:Системный анализ и моделирование экономических и экологических систем. Выпуск 1. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С.454–461.
  2. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б. Критерии диагностики клинически агрессивных форм рака предстательной железы // Экология. Экономика. Информатика. Сборник статей: в 2-х т. Т. 1:Системный анализ и моделирование экономических и экологических систем. Выпуск 1. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. 517–524.
  3. Архипова О.Е., Черногубова Е.А., Куролап С.А., Епринцев С.А. Эпидемиология рака предстательной железы в Воронежской области: пространственно-временная статистика// Вестник урологии. 2016. № 4. С. 45-55.
  4. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Прогностический потенциал показателя медико-экологической безопасности (HES) на примере Ростовской области // Экология. Экономика. Информатика. Серия: Системный анализ и моделирование экономических и экологических систем. 2017. Т. 1. № 2. С. 411-416.
  5. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Анализ заболеваемости раком предстательной железы в Ростовской области за 2001–2016 гг.: пространственно-временная статистика. //Вестник урологии. 2017;5(4):13-21.
  6. Черногубова Е.А. Маркёры воспаления при разных формах хронического абактериального простатита.// Вестник урологии. 2018;6(2):44-53. 
  7. Архипова О.Е., Черногубова Е.А., Лихтанская Н.В. Геоинформационное моделирование медико-экологической безопасности Южных регионов России//«ИнтерКарто/ИнтерГИС». 2018;24(1):109–122.   

Участие в конференциях, экспедициях.  

СТАТЬИ И ТЕЗИСЫ В МАТЕРИАЛАХ КОНФЕРЕНЦИЙ:
  1. Черногубова Е.А., Чибичян М.Б. Роли калликреин-кининовой и ренин-ангиотензиновой систем организма в пролиферативных процесах в предстательной железе//  Материалы XIV Российской научно-практической конференции с международным участием (Ростов-на-Дону, 15-16 мая 2015 г «Обмен веществ при адаптации и повреждении (Дни молекулярной медицины на Дону» - Ростов-на-Дону: ГБОУ ВПО РостГМУ Минздрава России, 2015.- С.138-142.
  2. Сурков Ф.А., Архипова О.Е., Лихтанская Н. В., Черногубова Е. А.,  Сенько О.В., Кузнецова А.В., Куролап С.А., Матишов Д.Г..  Оценка влияния качества окружающей среды на состояние здоровья населени//Экология, экономика, информатика. Сборник статей: в 3 т. – Ростов-на-Дону Издательство Южного федерального университета, 2015. ISBN 978-5-9275-1642-1 Т.1: Системный анализ и моделирование экономических и экологических систем, 2015. – С.-283- 287.  ISBN 978-5-9275-1643-8 (Т.1)
  3. Matishov D.G., Arkhipova O.E., Chernogubova Е.А., Aidinov G.T., Sinelnikova Ju.A. Epidemiology of the prostate cancer in the Rostov district. Temporal and spatial statistics//Geographic information technologies and prediction of extreme events. Collection of articles of the III International Conference (September 5-12, 24-28, 2015, Durso – Rostov-on-Don, Russia). –Rostov-on-Don: Publishing house SSC RAS, 2015. – P. 7-13. ISBN 978-5-4358-0115-6.
  4. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б.  Роль калликреин-кининовой и ренин-ангиотензиновой систем организма в пролиферативных процессах в предстательной железе. Экологическая стратегия развития прибрежных регионов: география, окружающая среда, население. Медико-экологические и социально-экономические проблемы прибрежных регионов: материалы Всероссийской научной конференции (г. Ростов-на-Дону, 15–18 декабря 2015 г.) / [глав. ред. Г.Г. Матишов]. – Ростов н/Д: Изд-во Южного научного центра РАН, 2015. – С.332-340.
  5. Черногубова Е.А. Анализ адаптивного потенциала протеолитических систем крови здоровых людей Экологическая стратегия развития прибрежных регионов: география, окружающая среда, население. Медико-экологические и социально-экономические проблемы прибрежных регионов: материалы Всероссийской научной конференции (г. Ростов-на-Дону, 15–18 декабря 2015 г.) / [глав. ред. Г.Г. Матишов]. – Ростов н/Д: Изд-во Южного научного центра РАН, 2015. – С.324-331.
  6. Коган М. И.  , Чибичян М. Б., Черногубова Е. А., Мационис А. Э., Повилайтите П. Э., Павленко И. А. Роль экспрессии рецепторов ангиотензина II в прогнозировании биохимического рецидива при раке предстательной железы// Онкоурология.  Материалы Х юбилейного Конгресса Российского общества онкоурологов.1-2 октября 2015 года, Москва . – 2015– С.66-67
  7. Архипова О.Е., Черногубова Е.А. Анализ пространственных закономерностей эпидемиологии рака простаты в Ростовской области//Экология. Экономика. Информатика. Сборник статей: в 2-х т. Т. 1: Системный анализ и моделирование экономических и экологических систем. Выпуск 1. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С.454-461.
  8. Черногубова Е.А., Коган М.И., Чибичян М.Б. Критерии диагностики клинически агрессивных форм рака предстательной железы// В сборнике: Экология. Экономика. Информатика Институт аридных зон, Южный научный центр РАН, Южный федеральный университет. Ростов-на-Дону, 2016. С. 417-524.
  9. Arkhipova O.E., Chernogubova E.A.  METHODS OF ESTIMATION OF THE MEDICO-ECOLOGICAL SAFETY OF THE SOUTHERN REGIONS OF RUSSIA //GEOID - Indicators of climate change in the marine ecosystem. Collection of articles of the IV International Conference (October 1–8, 2016, Sukhum – Rostov-on-Don, Russia). – Rostov-on-Don: Publishing house SSC RAS, 2016. –Р.11-15
  10. Архипова О.Е., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Коган М.И., Айдинов Г.Т., Синельникова Ю.А. «Горячие точки» заболеваемости раком предстательной железы в ростовской области. пространственно-временная статистика // Окружающая среда и человек. Современные проблемы генетики, селекции и биотехнологии: материалы международной научной конференции и молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова (г. Ростов-на-Дону, Россия, 5–8 сентября 2016 г.) / [гл. ред. акад. Г.Г. Матишов]. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С. 489–492.
  11. Коган М.И., Черногубова Е.А., Чибичян М.Б., Мационис А.Э., Повилайтите П.Э., Павленко И.А. Рецепторы ангиотензина II второго типа – предикторы рецидива рака предстательной железы // Окружающая среда и человек. Современные проблемы генетики, селекции и биотехнологии:материалы международной научной конференции и молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова (г. Ростов-на-Дону, Россия, 5–8 сентября 2016 г.) / [гл. ред. акад. Г.Г. Матишов]. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С. 523–526.
  12. Набока А.В. Влияние транскрипционных и посттранскрипционных этапов биогенеза микроРНК на ее наследуемую аберрантную экспрессию при действии митомицина С // Окружающая среда и человек. Современные проблемы генетики, селекции и биотехнологии: материалы международной научной конференции и молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова (г. Ростов-на-Дону, Россия, 5–8 сентября 2016 г.) / [гл. ред. акад. Г.Г. Матишов]. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С. 550–552.
  13. Тютякина М.Г., Махоткин М.А., Тарасов В.А. Создание трансфицирующих векторов для анализа роли miR-34a в регуляции клеточных процессов // Окружающая среда и человек. Современные проблемы генетики, селекции и биотехнологии: материалы международной научной конференции и молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова (г. Ростов-на-Дону, Россия, 5–8 сентября 2016 г.) / [гл. ред. акад. Г.Г. Матишов]. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С. 456–458.
  14. Чеботарев Д.А., Махоткин М.А. Различия профилей экспрессии микроРНК в клетках гормон-чувствительных и гормон-независимых линий рака простаты // Окружающая среда и человек. Современные проблемы генетики, селекции и биотехнологии: материалы международной научной конференции и молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова (г. Ростов-на-Дону, Россия, 5–8 сентября 2016 г.) / [гл. ред. акад. Г.Г. Матишов]. Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. С. 566–569.
  15. Тютякина М.Г., Махоткин М.А., Набока А.В., Тарасов В.А. Участие микроРНК в регуляции гормональной зависимости клеток рака простаты // Материалы научно-практической конференции с международным участием «Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции».2017.Ростов-на-Дону; Таганрог: Издательство Южного федерального университета. С. 149-150.
  16. Коган М.И., Чибичян М.Б., Черногубова Е.А. Маркеры клинически агрессивных форм рака предстательной железы после радикальной простатэктомии // Материалы XII Международного конгресса Российского общества онкоурологов, (г. Москва, 5–6 октября 2017.) М.: Онкоурология. 2017. С.43-44.
  17. Архипова О.Е, Черногубова О.Е., Тарасова Т.Т., Лихтанская Н.В. Технология оценки социально-экономических последствий морских опасных явлений в прибрежной зоне азовского моря. Материалы Международной молодежной научной конференции памяти члена-корреспондента РАН Д.Г.  Матишова Дельты рек России: закономерности формирования, биоресурсный потенциал, рациональное хозяйствование и прогнозы развития (г.  Ростов-на-Дону, 4–6  сентября 2018  г.) / [гл. ред. акад.  Г.Г. Матишов]. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2018. – С.13-17.  ISBN 978-5-4358-0174-3.
  1. Архипова О.Е., Черногубова Е.А., Тарасова Т.Т. Социально-экономические и медико-экологические последствия от морских опасных явлений в прибрежной зоне азовского моря//Закономерности формирования и воздействия морских, атмосферных опасных явлений и катастроф на прибрежную зону РФ в условиях глобальных климатических и индустриальных вызовов («Опасные явления»): материалы Международной научной конференции (г. Ростов-на-Дону, 13–23 июня 2019 г.). – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2019. – С.310-313  (ISBN 978-5-4358-0182-8).

 Основные результаты (2015-2019 гг.) с фотографиями.

1. Наши исследования направлены на идентификацию и анализ эпигенетических факторов, обуславливающих инициацию и развитие злокачественных опухолей человека, изучение элементов сигнальных путей, задействованных в регулировании клеточного цикла, апоптоза, клеточной пролиферации, - биологических процессов, нормальное протекание которых нарушается при многоступенчатой онкотрансформации клетки и, на этой основе,  создание концептуально новых методов диагностики и терапии онкологических заболеваний.
Комплексный подход к изучению процессов инициации и прогрессии рака предстательной железы включает следующие направления исследований:
Согласно современным представлениям, инициация и развитие злокачественных опухолей в значительной степени обусловлены эпигенетическими изменениями, которые, в отличие от генетических мутаций, обратимы и могут служить мишенью при разработке терапевтических средств лечения рака. МикроРНК играют важную роль в эпигенетических изменениях. Они контролируют функционирование группы генов, определяющих такие процессы как деление клеток, апоптоз и стабильность генома, которые, как известно, лежат в основе прогрессии опухоли. Злокачественный рост клеток вызывается аберрантной экспрессией определенных микроРНК, и ее нормализация приводит к остановке роста и дальнейшему уменьшению опухоли. Как следствие, микроРНК могут использоваться как в диагностике, так и в лечении рака. В связи с этим, одним из направлений  работы лаборатории является создание специальных генно-инженерных конструкций для регистрации эффективности гомологичной рекомбинации в соматических клетках млекопитающих.
    Большая часть генетических исследований связана с выяснением прогностической роли экспрессии паттерна генетических локусов в мононуклеарной фракции периферической крови потенциально информативных для идентификации онкологической трансформации.
Результаты исследований:
• Создана хорошо охарактеризованная коллекция образцов нормальной и опухолевой ткани простаты,ткани опухолей толстой кишки, а также образцов плазмы крови пациентов до и после проведения радиотерапии. В настоящее время в ней содержится более ста образцов ткани простаты.
• Идентифицированы микроРНК и их кластеры, ассоциированные с развитием рака толстой кишки и простаты. Идентифицированы микроРНК, сохраняющие аберрантную экспрессию в ряду клеточных поколений после действия ионизирующей радиации и хорошо известного цитостатика – митомицина С.
• Показано, что индуцированная аберрантная экспрессия микроРНК регулируется не только изменением транскрипционной активности их генов, но и изменением эффективности их дифференциального созревания. Причем впервые показано, что в дифференциальную экспрессию микроРНК, индуцированную повреждениями ДНК, включен процесс селекции нитей микроРНК при формировании комплекса RISC.
• Впервые установлено, что в сохранении в ряду клеточных поколений аберрантной экспрессии микроРНК при действии мутагенов основную роль играет индуцированное аберрантное метилирование ДНК. При этом в качестве мишеней аберрантного метилирования ДНК выступают гены микроРНК либо гены, белковые продукты которых контролируют их дифференциальное созревание.
• При использовании многократного дробного облучения гамма-квантами получены и охарактеризованы радиорезистентные варианты клеточных линий HeLa и DU-145.
• Идентифицированы микроРНК, участвующие в регуляции гормональной зависимости клеток рака простаты и радиорезистентности их гормон-независимого варианта (Рисунок 1).

Рисунок 1.

• В настоящее время проводятся работы по анализу уровня метилирования промоторных участков генов индивидуальных микроРНК и их копийности на радиорезистентность клеток рака простаты.
 

  1. При выполнении прикладных научных исследований и экспериментальных разработок в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы»  нами идентифицированы принципиально новые маркеры клинически агрессивных форм рака предстательной железы (РПЖ).  

Болезньориентированный биобанкдал возможность адекватного формирования выборок для исследований, в соответствии с задачами исследования,обеспечил анализ ассоциаций между клиническими параметрами и биомаркерами.Программного комплекса «Регистр пациентов Medical» (Программа для ЭВМ «Программный комплекс «Регистр пациентов Medical», РФ, Свидетельство о регистрации программ 2016663807 от 16.12.2016) сформированы компьютерные регистры пациентов с постоянным пополнением выборки и данных по мониторингу пациентов с РПЖ после радикальной простатэктомии и гормонолучевой терапии (Рисунок 2).. База данных содержит не только клиническую информацию о пациенте, но ее структура пригодна для автоматического анализа данных, что позволяет проводить ретроспективные исследования и выявлять клинически значимые изменения в молекулярном профиле опухоли на основании проведенных ранее исследований.

Рисунок 2
Идентифицированные маркеры позволяют выделить группу пациентов с высоким риском развития клинически агрессивных форм РПЖ после радикальной простатэктомии на основе анализа особенностей воспалительно-фибротических изменений в препарате предстательной железы после операции и при совместном определении активности  ангиотензинпревращающего фермента (АПФ) и содержания простатоспецифического антигена (ПСА) в крови через 1 месяц после радикальной простатэктомии (РПЭ). Установлено, что прогрессия РПЖ после радикальной простатэктомии ассоциирована с увеличением активности АПФ в крови, причем активность АПФ начинает расти раньше, чем отмечается прогрессия заболевания в виде развития биохимического рецидива. Совместное определение АПФ и ПСА в крови позволяет выделить группу пациентов с высоким риском развития агрессивных форм рака предстательной железы после радикальной простатэктомии с чувствительностью и специфичностью 72,7% (р<0,001), 91,2 % (р<0,001) соответственно.
Идентифицированные маркеры позволяют выделить группу пациентов с высоким риском развития клинически агрессивных форм РПЖ после гормонолучевой терапии (ГЛТ) на основе анализа экспрессии рецепторов ангиотензина II в ткань предстательной железы до начала лечения и при совместном определении активности АПФ и содержания ПСА в крови через 1 месяц после ГЛТ. Анализ экспрессии рецепторов ангиотензина II второго типа (АТ2-R) в ткань простаты больных РПЖ до начала лечения позволяет выделить пациентов с высоким риском развития рецидива заболевания после ГЛТ и выбрать в отношении их оптимальную терапевтическую стратегию. При использовании модели предсказания биохимической прогрессии после гормонолучевой терапии в зависимости от значения АТ2-R в ткани простаты чувствительность теста составляет 87,5% (p<0,01), специфичность – 85,71% (p<0,01). Результаты исследования показали, что развитие клинически агрессивных форм РПЖ после гормонолучевой терапии ассоциировано с увеличением активности АПФ в крови, причем активность АПФ начинает расти раньше, чем отмечается прогрессия заболевания в виде развития биохимического рецидива. Совместное определение АПФ и ПСА в крови позволяет выделить группу пациентов с высоким риском развития агрессивных форм рака предстательной железы после гормонолучевой терапии с чувствительностью и специфичностью - 78,6 % (р<0,001), 94,6% (р<0,001) соответственно.
Разработаны алгоритмы диагностики клинически агрессивных форм рака простаты  (Рисунок 3)




Рисунок 3
На основе анализа молекулярных механизмов развития рецидива рака предстательной железы после радикальной простатэктомии и гормонолучевой терапии научно обоснована панель диагностических тестов для прогнозирования развития клинически агрессивных форм рака простаты.
Разработана тест-система (диагностическая панель тестов) диагностики и прогнозирования клинически агрессивных форм рака предстательной железы, включающая диагностическую панель тестов для идентификации клинически агрессивных форм рака предстательной железы после радикальной простатэктомии; диагностическую панель тестов для идентификации клинически агрессивных форм рака предстательной железы после гормонолучевой терапии и компьютерный регистр пациентов Medical, с постоянным пополнением выборки и данных по мониторингу пациентов с РПЖ после РПЭ и ГЛТ, с возможностью автоматического анализа данных.
Разработаны предложения по организации и проведению дальнейших исследований, направленных на валидацию идентифицированных маркеров инициации и прогрессии рака предстательной железы. Предложения по организации и проведению дальнейших исследований, направленных на валидацию идентифицированных маркеров инициации и прогрессии рака предстательной железы связаны организацией мультицентровых когортных исследований идентифицированных маркеров клинически агрессивных форм рака предстательной железы. Анализ и обобщенные результаты этих исследований станут основанием для введения в реальную клиническую практику маркеров клинически агрессивных форм рака предстательной железы.
Технико-экономическая оценка результатов исследования показала, что идентифицированные маркеры клинически агрессивных форм рака предстательной железы могут быть использованы для прогнозирования эффективности лечения рака простаты и раннего выявления риска развития рецидива заболевания в российских онкологических учреждениях. Разработанный прототип тест-системы диагностики и прогноза клинически агрессивных форм рака предстательной железы обладает конкурентоспособностью на мировом рынке и большим коммерческим потенциалом. Объекты интеллектуальной собственности, созданные в ходе выполнения проекта, способствуют активизации импортозамещения в сфере диагностики опухолевых заболеваний. Использование отечественных инновационных технологических разработок при создании новых диагностических средств повышает их доступность не только для населения, но и для государства.
 
3. Изучена ультраструктура сомы медленно -  и быстро – адаптирующегося  нейрона  Astacus Leptodactylus с особым вниманием к функциональным различиям между двумя системами. Описаны и количественно оценены особенности  тонкого строения основных клеточных органелл: выявлена относительно высокая концентрация митохондрий в чувствительных клетках рецептора медленного типа, а также более развитая эндоплазматическая сеть  в  нейронах быстрой системы. Предполагается, что эти различия между рецепторами двух типов  могут быть частично ответственны за различные пороги чувствительности и скорость адаптации, наблюдаемые в физиологических экспериментах
4.Исследовано  влияния высокого химического загрязнения почв на рост, структуру корня и стебля растений тростника Phragmites australis Cav. (Рисунок 4).



Рисунок 4
Изучались почвы и растения площадок мониторинга зоны промышленных отстойников сточных вод и шламо - накопителей г. Каменска - Шахтинского (юг России). Показано, что высокий уровень загрязнения почв способствует замедлению онтогенетического развития растений, уменьшению их морфометрических параметров. Электронно-микроскопическое исследование растений выявило изменение ультраструктуры клеточных мембран, а также основных цитоплазматических органелл корня и стебля (митохондрий, пластид, и др.). Предполагается, что выявленные структурные изменения эпидермиса и мезодермы при воздействии металлов препятствуют радиальному перемещению жидкости в корне от периферических участков и являются одной из причин снижения уровня поглощения и транслокации минеральных питательных веществ от корней к побегам .
5. Впервые было проведено исследование ультраструктурных изменений корней, стеблей и листьев ячменя H. sativum,  вызванных токсичностью Cu в гапличном чернозёме (Рисунок 5). Наиболее значительные изменения из-за токсичности меди были выявлены  в корневых структурах, в том числе: деградация эпидермиса, уменьшение количества клеток паренхимы и уменьшенный диаметр стелы с нарушением и модификацией её внутреннего состава. Изучение этих эффектов на ультраструктурном уровне позволило идентифицировать клеточные мишени и основные точки воздействия токсичности металла на растения.

Рисунок 5

6. Физиология и сомнология. Исследования на основе экспериментов, выполненных на животных, и результатов обследований лиц без нарушений здоровья, а также пациентов с сомнологическими расстройствами развивается представление о решающей роли индивидуальности в регуляции сна. Она во многом детерминирована генетически и обусловлена активационными механизмами мозга, определяющими персонификацию сна и протекание его расстройств, а также поведенческую
реактивность (тревожное реагирование) организма в бодрствовании. Такой подход позволяет по-новому посмотреть на понимание адаптивной функции сна теплокровного организма, взаимодействующего с факторами среды в цикле «сон – бодрствование» и разработать современные пути контроля индивидуального развития расстройств сна. 
• Показано, что риску инсомнических расстройств сна больше повержены лица с высоким уровнем личностной тревожности. Они также уязвимы к стрессорным и экстенсивным, вплоть до экстремальных, влияниям окружающей среды. 
• В условиях высокогорья индивидуальная стратегия контроля сомнологических и физиологических перестроек организма позволяет адекватно оценивать адаптацию человека, представить пути ее развития и осознать границы. 
• Изучение сезонных изменений Каспийского моря позволило выявить направление и глубину реорганизации популяции каспийского тюленя. Анализ краниометрических и генетических показателей указывает на возможность существования подпопуляций с особенностями ареала их преимущественного обитания. Установлены различия северной и южной популяций каспийского тюленя, обусловленные комплексными генетическими и экологическими влияниями, а также целым рядом других факторов.


Архивные фото:



 

Научное оборудование