Матишов Г.Г., Макаревич П.Р., Моисеев Д.В. Климат и большие морские экосистемы Арктики: доклад на Президиуме РАН, 24 мая 2016 г. Ростов н/Д: Изд. ЮНЦ РАН, 2016. 96 с. ISBN 978-5-4358-0139-2
Опыт выращивания пиленгаса Азовского моря в условиях аквакомплекса / Г.Г. Матишов, В.П. Коваленко, Д.А. Бухмин, М.В. Коваленко. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2016. – 44 с. – ISBN 978-5-4358-0129-3
Экологический атлас Азовского моря / гл. ред. акад. Г.Г. Матишов; отв. ред. Н.И. Голубева, В.В. Сорокина. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 328 с. – ISBN 978-5-4358-0020-3.
Цимлянское водохранилище: состояние водных и прибрежных экосистем, проблемы и пути решения / отв. ред. акад. Г.Г. Матишов. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 216 с. Ил.: 25. Табл.: 44. Библиогр.: 271 назв. – ISBN 978-5-4358-0001-2.
Тихоокеанская сайра. Научно-информационное обеспечение промысловой экспедиции / В.Н. Филатов, А.В. Старцев, Е.И. Устинова, Ю.В. Ерёмин; гл. ред. акад. Г.Г. Матишов. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 120 с. – ISBN 978-5-4358-0012-8.
Практическая аквакультура (разработки ЮНЦ РАН и ММБИ) / акад. Г.Г Матишов, Е.Н. Пономарёва, Н.Г. Журавлёва и др. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 284 с. – ISBN 978-5-4358-0024-1.
Биологические способы борьбы с амброзией полыннолистной в антропогенных фитоценозах юга России / Г.Г. Матишов, Л.П. Есипенко, Л.П. Ильина, И.С. Агасьева. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 144 с. Ил.: 33. Табл.: 21. Библиогр.: 114. – ISBN 978-5-4358-00
Батиева Е.Ф. Население Нижнего Дона в IX в. до н. э. – IV в. н. э. (палеоантропологическое исследование) / отв. ред. М.М. Герасимова. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2011. – 160 с. – ISBN 978-5-5-4358-27-2.
Социально-гуманитарные и экологические проблемы развития современной Адыгеи: сборник научных статей / отв. ред. акад. Г.Г. Матишов, Р.Д. Хунагов. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2012. – 584 с. – ISBN 978-5-4358-0028-9.
Матишов Г.Г., Клещенков А.В. Кубанский паводковый кризис. Климат, геоморфология, прогноз. Крымск, июль 2012 г. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2012. – 116 с. – ISBN 978-5-4358-0041-8.